Cytologie betekent celleer. In het cytologisch laboratorium vindt onderzoek plaats op losse cellen. Deze cellen kunnen worden verkregen door afschrapen (denk aan baarmoederhalsuitstrijkjes), spontane lozing (onder andere cellen in urine), ophoesten (sputum) of door aanprikken met een dunne naald (orgaanpuncties).

Een belangrijk deel van de werkzaamheden wordt gevormd door de technische verwerking en microscopische beoordeling van baarmoederhalsuitstrijkjes, die zijn gemaakt op medische indicatie of in het kader van het bevolkingsonderzoek. Binnen het laboratorium wordt voor dit onderzoek gebruik gemaakt van de zogenaamde dunne laag methode. Hierbij wordt het celmateriaal niet rechtstreeks op een glaasje uitgestreken maar overgebracht in een potje met fixatievloeistof. In het laboratorium wordt dit materiaal met behulp van een apparaat verwerkt tot een microscopisch preparaat. Het voordeel van deze techniek is dat het preparaat slechts uit één cellaag bestaat. Dat komt een adequate microscopische beoordeling ten goede.